Absolwentka Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego oraz Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego. Posiada kwalifikacje dla kierowników ds. ochrony, osób bezpośrednio nadzorujących personel stosujący środki kontroli w zakresie ochrony, a także wykonujących obowiązki związane z zagrożeniami dla cyberbezpieczeństwa. Dysponuje również doświadczeniem oraz przygotowaniem zawodowym w zakresie stosowania środków ochrony dotyczących ładunku i poczty lotniczej innych niż kontrola bezpieczeństwa.
W ramach działalności Avsec.p utrzymuje regularny kontakt z klientami, udziela im wsparcia w kwestiach związanych z ochroną lotnictwa cywilnego oraz wspiera ich w korzystaniu i rozwoju platformy szkoleniowej Avsec Control.
Agata Kowalczyk jest zatwierdzonym przez Prezesa Urzędu Lotnictwa Cywilnego Wewnętrznym Audytorem Kontroli Jakości.